Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rtn3Q9ES97 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms