Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clstn2Q9ER65 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clstn2Q9ER65 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms