Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ndst3Q9EQH7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms