Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgshQ9EQ08 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms