Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Cep19-203ENSMUST00000169186 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm13674-201ENSMUST00000121276 823 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm5530-201ENSMUST00000117185 985 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Riok3Q9DBU3 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms