Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms