Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chmp2aQ9DB34 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms