Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Pop5Q9DB28 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Pop5Q9DB28 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Pop5Q9DB28 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Pop5Q9DB28 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pop5Q9DB28 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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