Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Subh2bvQ9D9Z7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Subh2bvQ9D9Z7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Subh2bvQ9D9Z7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Subh2bvQ9D9Z7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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Subh2bvQ9D9Z7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Subh2bvQ9D9Z7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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