Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp12Q9D9M2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms