Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gtf3c6Q9D8P7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gtf3c6Q9D8P7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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