Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D7E4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms