Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn23Q9D7D7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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