Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D727 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D727 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D727 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D727 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D727 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D727 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D727 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D727 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D727 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D727 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D727 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D727 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D727 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D727 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D727 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D727 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms