Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc3Q9D6Y1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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