Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc39Q9D5Y1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc39Q9D5Y1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms