Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ubxn11Q9D572 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn11Q9D572 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms