Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms