Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PrameQ9D4Z5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms