Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D4W2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D4W2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms