Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Efhd1Q9D4J1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Efhd1Q9D4J1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Efhd1Q9D4J1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Efhd1Q9D4J1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Efhd1Q9D4J1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Efhd1Q9D4J1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms