Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pus10Q9D3U0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pus10Q9D3U0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms