Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krt20Q9D312 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt20Q9D312 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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