Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift27Q9D0P8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift27Q9D0P8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift27Q9D0P8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift27Q9D0P8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift27Q9D0P8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift27Q9D0P8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift27Q9D0P8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift27Q9D0P8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift27Q9D0P8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift27Q9D0P8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift27Q9D0P8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift27Q9D0P8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift27Q9D0P8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift27Q9D0P8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift27Q9D0P8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift27Q9D0P8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift27Q9D0P8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ift27Q9D0P8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ift27Q9D0P8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ift27Q9D0P8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ift27Q9D0P8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ift27Q9D0P8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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