Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms