Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sgo1Q9CXH7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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