Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxxc1Q9CWW7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms