Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkrip1Q9CWV6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms