Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NubplQ9CWD8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms