Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pard3bQ9CSB4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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