Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg12Q9CQY1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms