Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Mrpl20Q9CQL4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Mrpl20Q9CQL4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Mrpl20Q9CQL4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Mrpl20Q9CQL4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Mrpl20Q9CQL4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Mrpl20Q9CQL4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Mrpl20Q9CQL4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Mrpl20Q9CQL4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Mrpl20Q9CQL4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl20Q9CQL4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Mrpl20Q9CQL4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Mrpl20Q9CQL4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl20Q9CQL4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Mrpl20Q9CQL4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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