Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp6v0e1Q9CQD8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms