Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trappc5Q9CQA1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms