Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms