Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Smim3Q99PE5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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