Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atoh8Q99NA2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms