Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdac9Q99N13 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms