Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ms4a4dQ99N05 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms