Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

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Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Rnf17Q99MV7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Rnf17Q99MV7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Rnf17Q99MV7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Rnf17Q99MV7 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf17Q99MV7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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