Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tdrd1Q99MV1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms