Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SncaipQ99ME3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms