Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5rap3Q99LM2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms