Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp11Q99K46 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp11Q99K46 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms