Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smarcd2Q99JR8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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