Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin3Q99JB8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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