Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apobec3Q99J72 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms