Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms