Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cldn16Q925N4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms