Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trps1Q925H1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trps1Q925H1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trps1Q925H1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trps1Q925H1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trps1Q925H1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trps1Q925H1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trps1Q925H1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trps1Q925H1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trps1Q925H1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trps1Q925H1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trps1Q925H1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trps1Q925H1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms